Farba normálnej stolice, ktorá má byť hnedá, je výsledkom zloženia prijímanej potravy a procesov prebiehajúcich najmä v čreve. V niektorých prípadoch sa človek môže stretnúť s tým že spozoruje neobvyklé zafarbenie alebo konzistenciu, pričom každá zmena môže mať banálnu ale aj vážnu príčinu. 

V prípade čierneho zafarbenia sa tiež nemusí ihneď jednať o varovný príznak. Treba vziať do úvahy možnú konzumáciu niektorých potravín alebo liekov. Medzi potraviny známe tým, že spôsobujú čierne zafarbenie stolice patria napríklad: čučoriedky, červená repa, horká čokoláda, sladké drievko (pelendrek), niektoré mäsové výrobky (klobása). 

Lieky a voľne dostupné doplnky výživy taktiež dokážu spôsobiť čierne zafarbenie. Najčastejšie sa jedná o lieky alebo doplnky s obsahom železa. Mnoho ľudí užívajúcich železo sa môže stretnúť aj s ďalšími pridruženými príznakmi ako nevoľnosť, bolesť brucha alebo zápcha. Je preto namieste sa v takomto prípade poradiť ohľadom liečby s lekárom, ktorý môže navrhnúť zmenu lieku. Dá sa tak vyhnúť nepríjemným nežiadúcim účinkom. Okrem liekov s obsahom železa sa na čiernom zafarbení môžu podieľať aj lieky, ktorých zloženie zahŕňa bizmut alebo aktívne uhlie. Ide o lieky používané pri liečbe ochorení a ťažkostí spojených s trávením. 

Ak je stolica redšia, dechtovitá a výrazne čierna, ide o vážny stav a takáto stolica sa odborne nazýva meléna. Jej príčinou je krvácanie do horných častí tráviaceho traktu. Vzniká tým, že krv prechádza cez tráviaci trakt, kde na ňu pôsobia tráviace enzýmy organizmu. V prípade spozorovania takejto neprirodzenej formy stolice je nevyhnutá okamžitá návšteva lekára. Nutné je vykonanie diagnostických postupov, hlavne endoskopických zobrazovacích techník, aby bolo možné odhaliť príčinu. 

Príčiny spôsobujúce melénu môžu byť v rôznych oblastiach hornej časti tráviaceho systému. Jednou z veľmi častých prípadov je krvácanie z vredu. Pacient okrem čiernej stolice zvyčajne pociťuje aj iné symptómy ako napríklad bolesť brucha alebo nevoľnosť. Riziko výskytu vredov sa zvyšuje s častým používaním nesteroidných protizápalových liekov alebo pri prítomnosti infekcie Helicobacter pylori.

Ďalšou veľmi vážnou príčinou je krvácanie z pažerákových varixov. Takáto komplikácia nastáva u ľudí s cirhózou pečene. Dochádza vtedy zväčšeniu náplne žíl, z ktorých sa následne môže spustiť krvácanie, čo sa prejaví čiernou stolicou alebo aj vracaním čerstvej krvi. 

Dlhé a usilovné vracanie, obyčajne po alkoholovom excese, môže poškodiť sliznicu pažeráka. Na sliznici sa vytvoria krvácajúce trhliny, ktoré môžu byť tiež príčinou melény. Takýto stav nazývame Mallory-Weiss syndróm.

Okrem vyššie spomenutých stavov môžu byť krvácanie a výsledná meléna spôsobené aj nádorovými ochoreniami pažeráka a žalúdka. Zväčša na nich myslíme vtedy, ak má pacient aj iné ťažkosti, napríklad problémy s prijímaním potravy alebo rýchly úbytok hmotnosti.